Services
Inventaire de biodiversité et identification d’espèces
Vous souhaiteriez effectuer des inventaires faunistiques précis ou identifier la présence d’espèces menacées ou invasives sur un site donné ? Nous vous proposons divers outils génétiques pour répondre à vos questions.
Pour les inventaires faunistiques et biomonitorings, différentes techniques existent en fonction des organismes recherchés.
Pour les milieux aquatiques, la recherche de poissons, d'amphibiens, de mammifères aquatiques et semi aquatiques ou de macro invertébrés aquatiques est effectuée sur base de prélèvements d’eau à partir de capsules filtrantes et de pompes péristaltiques louées sur demande. Ces technologies permettent d’effectuer des inventaires extrêmement précis pour ces organismes, grâce notamment à nos bases de données de références privées.
Pour les inventaires faunistiques et biomonitorings, différentes techniques existent en fonction des organismes recherchés.
Pour les milieux aquatiques, la recherche de poissons, d'amphibiens, de mammifères aquatiques et semi aquatiques ou de macro invertébrés aquatiques est effectuée sur base de prélèvements d’eau à partir de capsules filtrantes et de pompes péristaltiques louées sur demande. Ces technologies permettent d’effectuer des inventaires extrêmement précis pour ces organismes, grâce notamment à nos bases de données de références privées.
Pour les milieux terrestres, d’autres techniques de prélèvement sont également disponibles comme la récolte d’échantillons de sol, ou encore la collecte de poils, frottis, fèces, urine, salive grâce à une série de dispositifs non invasifs mis au point en collaboration avec nos collègues du GREGE (Groupe de Recherche et d’Etude pour la Gestion de l’Environnement).
Ces approches permettent de déterminer génétiquement à quelles espèces ou groupes d’espèces ces échantillons appartiennent. Cette méthode est particulièrement intéressante pour identifier les espèces difficiles à observer par les techniques classiques ou encore d’effectuer des inventaires faunistiques globaux d’un milieu aquatique ou terrestre.
Forts de notre longue expérience dans le domaine de l’ADN environnemental et les technologies de séquençage de dernière génération, nous vous proposons des inventaires extrêmement précis et efficaces.
Recherche d’espèces rares et menacées ou au contraire, d’espèces invasives
Grâce à nos approches de séquençage de dernière génération, de métabarcoding et de barcoding, nous vous proposons d’identifier la présence possible d’espèces d’intérêts.
Ces espèces peuvent correspondre à des espèces patrimoniales et protégées (ex. desman des Pyrénées, vison d’Europe, crossope aquatique, campagnol amphibie, triton crêté, écrivesse à pattes blandes..) ou au contraire à des espèces invasives (ex. écrevisses américaines, castor canadien, vison d’Amérique, amphibiens invasifs…).
Forts de notre longue expérience dans le domaine de l’ADN environnemental et les technologies de séquençage de dernière génération, nous vous proposons des inventaires extrêmement précis et efficaces.
Recherche d’espèces rares et menacées ou au contraire, d’espèces invasives
Grâce à nos approches de séquençage de dernière génération, de métabarcoding et de barcoding, nous vous proposons d’identifier la présence possible d’espèces d’intérêts.
Ces espèces peuvent correspondre à des espèces patrimoniales et protégées (ex. desman des Pyrénées, vison d’Europe, crossope aquatique, campagnol amphibie, triton crêté, écrivesse à pattes blandes..) ou au contraire à des espèces invasives (ex. écrevisses américaines, castor canadien, vison d’Amérique, amphibiens invasifs…).
Régime alimentaire
Vous désirez connaitre le régime alimentaire d’une espèce sur un territoire donné afin de mieux comprendre son intérêt pour la régulation d’espèces proies potentiellement négatives pour l’homme ? Vous désirez connaitre le régime alimentaire d’une espèce menacée afin de mieux connaitre sa biologie et mettre en place les meilleures mesures de gestion pour celle-ci ? Vous désirez étudier l’impact d’une espèce invasive sur la biodiversité de nos régions ?
Nous vous proposons d’effectuer des analyses de régime alimentaire précises à partir de fèces collectées de manière non invasive, via l'utilisation des techniques de séquençage nouvelle génération et d’approches de métabarcoding.
Ce type d’étude a été développé par notre équipe sur de nombreuses espèces de mammifères : loutre européenne, loup européen, sanglier, vison d’Europe, vison d’Amérique, mangouste de Java, de nombreuses espèces de chauves-souris (oreillards, murins, pipistrelles..)…
Nous vous proposons d’effectuer des analyses de régime alimentaire précises à partir de fèces collectées de manière non invasive, via l'utilisation des techniques de séquençage nouvelle génération et d’approches de métabarcoding.
Ce type d’étude a été développé par notre équipe sur de nombreuses espèces de mammifères : loutre européenne, loup européen, sanglier, vison d’Europe, vison d’Amérique, mangouste de Java, de nombreuses espèces de chauves-souris (oreillards, murins, pipistrelles..)…
Etude des problèmes d’hybridation
Les marqueurs développés au sein de notre structure permettent d’étudier de manière précise les phénomènes d’hybridation existant entre espèces menacées et espèces domestique ou invasives.
Notre expertise concerne particulièrement le phénomène d’hybridation entre le chat forestier européen et le chat domestique. Il concerne également l’hybridation entre le sanglier européen et le cochon domestique ou encore l’hybridation entre le vison Européen, espèce en danger critique d’extinction et le putois européen.
Notre expertise concerne particulièrement le phénomène d’hybridation entre le chat forestier européen et le chat domestique. Il concerne également l’hybridation entre le sanglier européen et le cochon domestique ou encore l’hybridation entre le vison Européen, espèce en danger critique d’extinction et le putois européen.
Détermination d'effectifs, analyse de connectivité entre populations, estimation du risque de consanguinité et de la diversité génétique d’une population
Sur base de différents marqueurs génétiques hypervariables (microsatellites, marqueurs SNPs) et la collecte de très faibles quantités d’ADN, nous vous proposons d'évaluer la taille des effectifs de populations d'une espèce vertébrée ou invertébrée, en se basant uniquement sur des échantillons de poils, de fèces, d’urine, de salive ou de toute particule organique provenant de l’espèce ciblée.
Sur base des mêmes marqueurs moléculaires et selon des approches de génétique des populations, nous pouvons également apporter des informations concernant la connectivité entre populations isolées, leur risque de consanguinité ou encore leur niveau de diversité génétique.
Ce type d’analyse est particulièrement préconisé pour l’étude d’espèces rares ou élusives difficiles à échantillonner ou à observer. Notre expérience dans le domaine concerne de nombreuses espèces comme la loutre européenne, le loup européen, le desman des Pyrénées, le vison d’Europe, le cuivré de la bistorte, le hibou Grand Duc, le lion d’Afrique ou encore l’ours polaire..
Sur base des mêmes marqueurs moléculaires et selon des approches de génétique des populations, nous pouvons également apporter des informations concernant la connectivité entre populations isolées, leur risque de consanguinité ou encore leur niveau de diversité génétique.
Ce type d’analyse est particulièrement préconisé pour l’étude d’espèces rares ou élusives difficiles à échantillonner ou à observer. Notre expérience dans le domaine concerne de nombreuses espèces comme la loutre européenne, le loup européen, le desman des Pyrénées, le vison d’Europe, le cuivré de la bistorte, le hibou Grand Duc, le lion d’Afrique ou encore l’ours polaire..
Identification de pathogènes et étude de microbiomes bactériens
L’expertise de notre équipe permet d'estimer de manière précise les microbiomes bactériens présents dans un environnement particulier ou encore au sein d’animaux appartenant à des espèces d’intérêt (ex. tiques, moustiques, rongeurs, chauves-souris…). Ces approches permettent de mettre en place de véritables screening des communautés bactériennes au sein des organismes ou environnements analysés.
Ces analyses permettent également de détecter la présence potentielle d’agents pathogènes, avec une précision supérieure aux technologies classiques, grâce au développement de nouveaux marqueurs génétiques et l’utilisation systématique de technologies de séquençage de dernière génération.
Ces approches, développées notamment avec l’Institut Pasteur ou encore l’Hôpital Universitaire de l’Université de Liège (Belgique) permettent l’identification de pathogènes tels que les bactéries Borrelia, responsables de la maladie de Lyme ou encore d’autres groupes de bactéries particulièrement dangereux pour l’homme (ex. genres Bartonella, Yercinia, Bacillus, Leptospira…).
Ces analyses permettent également de détecter la présence potentielle d’agents pathogènes, avec une précision supérieure aux technologies classiques, grâce au développement de nouveaux marqueurs génétiques et l’utilisation systématique de technologies de séquençage de dernière génération.
Ces approches, développées notamment avec l’Institut Pasteur ou encore l’Hôpital Universitaire de l’Université de Liège (Belgique) permettent l’identification de pathogènes tels que les bactéries Borrelia, responsables de la maladie de Lyme ou encore d’autres groupes de bactéries particulièrement dangereux pour l’homme (ex. genres Bartonella, Yercinia, Bacillus, Leptospira…).
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